Unikonta es una célula eucariota con un solo flagelo, por lo menos ancestralmente. La investigación actual sugiere que un Unikonta fue el antepasado de Opisthokonta y Amoebozoa, mientras que un Bikonta (una célula eucariota con dos flagelos) fue el antepasado de Archaeplastida, Excavata, Rhizaria y Chromalveolata.

Los Unikonta también se caracterizan por una fusión de genes triple de la que carecen los Bikonta, y un solo centriolo (Cavalier-Smith, 2002, 2006). (Algunos Unikonta tienen dos centriolos pero su origen es diferente al de los bikonts, lo que indica una evolución convergente (Cavalier-Smith 2006). Los tres genes que están fusionados en los Unikonta pero no en las bacterias ni en los Bikonta codifican las enzimas para la síntesis de los nucleótidos pirimidínicos: carbamoyl phosphate synthase, dihydroorotase, aspartate carbamoyltransferase (Cavalier-Smith 2006). Esto debe haber implicado una fusión doble, un rara cadena de acontecimientos que es poco probable que sea revertido, lo que apoya la ascendencia compartida de Opisthokonta y Amoebozoa.